Instituto Nacional de Salud analizó el genoma del virus Monkeypox del primer caso de la viruela del mono en el país

Instituto Nacional de Salud analizó el genoma del virus Monkeypox del primer caso de la viruela del mono en el país

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Ante la Alerta Epidemiológica AE 014-2022 y el informe técnico N.º 035-2022-UIE-CNSP/INS, que recomienda la investigación por laboratorio de todo caso probable de viruela del mono, el Ministerio de Salud a través del Instituto Nacional de Salud, realizó el análisis genómico del virus Monkeypox obtenida de una lesión vesicular lde un paciente con viruela del mono.

Tras el análisis de la muestra analizada mediante un protocolo metagenómico de secuenciamiento masivo NGS del hisopado de la lesión dérmica, tomada el 26 de junio del 2022, que resultó positivo al PCR en tiempo real específico para el virus Monkeypox.
Siguiendo las recomendaciones brindadas por la OMS, el Instituto Nacional de Salud, realizó el secuenciamiento masivo de la muestra y obtuvo 8.2 millones de reads o secuencias de la muestra de este paciente. La calidad de los reads obtenidas Q30 es mayor al 95%. El análisis de estas secuencias indica que 13,693 reads corresponden al Monkeypoxvirus (Figura 1).

Ante la Alerta Epidemiológica AE 014-2022 y el informe técnico N.º 035-2022-UIE-CNSP/INS, que recomienda la investigación por laboratorio de todo caso probable de viruela del mono, el Ministerio de Salud a través del Instituto Nacional de Salud, realizó el análisis genómico del virus Monkeypox obtenida de una lesión vesicular lde un paciente con viruela del mono.

Tras el análisis de la muestra analizada mediante un protocolo metagenómico de secuenciamiento masivo NGS del hisopado de la lesión dérmica, tomada el 26 de junio del 2022, que resultó positivo al PCR en tiempo real específico para el virus Monkeypox.
Siguiendo las recomendaciones brindadas por la OMS, el Instituto Nacional de Salud, realizó el secuenciamiento masivo de la muestra y obtuvo 8.2 millones de reads o secuencias de la muestra de este paciente. La calidad de los reads obtenidas Q30 es mayor al 95%. El análisis de estas secuencias indica que 13,693 reads corresponden al Monkeypoxvirus (Figura 1).

El análisis CAT-BAT indica que el 23% de estas secuencias corresponden al género Orthopoxviruses (Figura 2). Figura 2. Identificación taxonómica a nivel de especie filtrando los reads que son homólogos a secuencias de Homo sapiens.

Figura 3. Análisis filogenético de genomas completos de monkeypoxvirus usando el algoritmo

De acuerdo a lo establecido a la normativa vigente, se ha procedido a realizar el aislamiento domiciliario del paciente confirmado para el Monkeypoxvirus y la búsqueda de contactos a fin de identificar posibles casos positivos, que permitan evitar la diseminación del nuevo agente etiológico.
Cabe señalar que estos resultados, aportan información de secuencias del virus Monkeypox, útiles para la investigación filogenética que permita rastrear la diseminación del agente viral a nivel mundial. Siendo el Perú, el segundo país en realizar este estudio genómico en Sudamérica después de Brasil.

 URL: https://nextstrain.org/community/INS-LBBM/MONKEYPOX

Son determinantes para la investigación del agente etiológico de la infección, la calidad de la muestra, condiciones de conservación y el tiempo de transporte al laboratorio. 

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